Bevægelse og sport er en væsentlig del af det at gå på Stenhus Kostskole. Lærerne bruger ofte Cooporative Learning strukturer i undervisningen for, at eleverne skal have de optimale muligheder for at bevæge sig i forbindelse med undervisningen.

Bevægelse medvirker til at fremme sundhed hos børn og unge samt understøtte trivsel, motivation og læring i skolens fag. På Stenhus sker det gennem korte bevægelsesaktiviteter, hvor bevægelsesaktiviteten giver en pause mellem læringssekvenser og bidrager til at styrke motivationen og koncentrationen hos eleverne efterfølgende. Denne type aktivitet bliver ofte betegnet ”brain breaks” og indgår som en kombineret aktivitet med undervisningen. Bevægelse er også med til at styrke elevernes trivsel på skolen, da aktiviteter og lege giver eleverne et bedre sammenhold og gode relationer til hinanden.

På 5. klassetrin er der 4 idrætstimer om ugen, mens der er 2 timer i 6. til 9. klasse. Eleverne i 5. og 6. klasse har svømning en gang om ugen den ene halvdel af skoleåret. Svømningen foregår i Holbæk Sportsby, og eleverne møder ude i svømmehallen om morgenen og transporterer sig selv til skolen bagefter.